Amanda06 Olá, tudo bem?
O frete você pode configurar para que o cliente realize o pagamento, inserindo o valor do frete no custo do produto e oferecendo frete grátis em sua loja, ou pode criar um frete com um valor fixo, aonde o cliente será o responsável por pagar essa taxa.
Em relação aos fretes mais caros, você pode criar um frete para que o cliente arque com este valor, mas sempre verifique se há outros fornecedores que oferecem frete grátis ou um frete mais em conta!