dannielpinheiro Estava verificando aqui, você desabilitou várias opções de frete de dentro do Dropi Fretes na Nuvemshop (não se deve fazer isso pois pode causar problemas na hora de exibir os fretes), por favor habilite todas novamente, caso queira esconder algum frete basta desmarcar eles dentro do Dropi.
Após habilitar os fretes verifique novamente se volto a aparecer em sua loja. Lembre de testar com um cep diferente para limpar o cache da Nuvemshop.
OBS: O limite de 5 fretes por produto é da própria Nuvemshop, não é um limite do Dropi.